發(fā)布日期:2018-03-06
哈佛大學的化學生物學家David Liu領導的研究團隊設計出一種稱為xCas9新酶,可更多更有效地修改基因組中的位點,進而提高CRISPR-Cas9的效用,同時還可降低脫靶風險。這項研究結果以《Evolved Cas9 variants with broad PAM compatibility and high DNA specificity》為題發(fā)表在2月28日的《Nature》上。
CRISPR靶向特異性是由兩部分決定的,一部分是RNA嵌合體和靶DNA之間的堿基配對能力,另一部分是Cas9蛋白對靶DNA的3'末端發(fā)現的被稱為protospacer adjacent motif(PAM)的DNA序列上的識別能力。
PAM通常由NGG三個堿基構成(N為任意堿基)。
病毒入侵時,Cas1和Cas2編碼的蛋白將掃描這段外源DNA,并識別出PAM區(qū)域,然后將臨近PAM的DNA序列作為候選的原間隔序列。
隨后,Cas1/2蛋白復合物將原間隔序列從外源DNA中剪切下來,并在其他酶的協助下將原間隔序列插入臨近CRISPR序列前導區(qū)的下游。不同的Cas9的識別能力不同。
目前,最常用的實驗Cas9是從化膿性鏈球菌中分離而來,稱為spCas9,其在具有32億個堿基對的人基因組中,大約僅能正確識別其中的1/16序列。這就是CRISPR-Cas9技術的真正局限性。
Liu及其研究團隊對spCas9稍加改動,迫使spCas9在實驗室中迅速擴增,積累突變,再識別各種PAM序列并對臨近的DNA進行切割。他們最終獲得了xCas9,其可更廣泛地識別不同的PAM,從而使得Cas9的識別能力增加了至少4倍。
研究人員對該酶進行了測試,并將其與堿基編輯器組合,他們發(fā)現,改變后的xCas9的不僅提高了CRISPR-Cas9的效用,而且切割能力未受影響,甚至降低了脫靶風險,成功實現了雙贏。
連續(xù)進化的Cas9具有更寬的PAM兼容性
演變后的xCas9在人細胞中的轉錄激活和基因組DNA切割
另一方面,加利福尼亞大學圣地亞哥分校的生物工程師Prashant Mali說,同樣的方法可以用來改變Cas9酶的其他變體,包括一些有希望用于基因治療的相對較小的Cas9蛋白質。他說,那些蛋白質往往具有更為嚴格的限制性PAM序列,若能成功應用這項技術,對基因治療將是莫大福音!
加利福尼亞斯坦福大學的合成生物學家 Stanley Qi 稱這項工作“令人眼花繚亂”,并表示他的團隊渴望在實驗中應用此項成果。xCas9具有更廣泛的PAM識別和更高的特異性,這足夠令科學家們興奮,但是,在徹底挖掘出這項技術的潛力前,仍需要進行更多的測試。
參考文獻:
1.Powerful enzyme could make CRISPR gene-editing more versatile
2.Evolved Cas9 variants with broad PAM compatibility and high DNA specificity
來源:轉化醫(yī)學網